Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DENRO43583 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DENRO43583 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DENRO43583 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DENRO43583 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms