Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF1O43189 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF1O43189 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms