Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP290O15078 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP290O15078 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP290O15078 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP290O15078 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP290O15078 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CEP290O15078 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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CEP290O15078 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP290O15078 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CEP290O15078 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CEP290O15078 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CEP290O15078 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CEP290O15078 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP290O15078 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEP290O15078 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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