Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZSWIM8A7E2V4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZSWIM8A7E2V4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZSWIM8A7E2V4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZSWIM8A7E2V4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZSWIM8A7E2V4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZSWIM8A7E2V4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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