Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MBD3L3A6NE82 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MBD3L3A6NE82 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms