Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VWA8A3KMH1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms