Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms