Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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ECM1Q16610 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ECM1Q16610 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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