Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
USF2Q15853 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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