Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PRPF4BQ13523 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PRPF4BQ13523 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms