Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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