Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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