Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCZQ96LD1 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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