Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
USF2Q15853 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
USF2Q15853 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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