Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
R3HDM1Q15032 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
R3HDM1Q15032 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms