Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms