Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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TCIRG1Q13488 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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