Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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