Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CENPFP49454 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CENPFP49454 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms