Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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HOXD10P28358 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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HOXD10P28358 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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