Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SH3BP4Q9P0V3 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4Q9P0V3 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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