Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms