Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTHRC1Q96CG8 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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