Protein–RNA interactions for Protein: Q53LP3

SOWAHC, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOWAHCQ53LP3 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOWAHCQ53LP3 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOWAHCQ53LP3 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms