Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C4orf17Q53FE4 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms