Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRIM28Q13263 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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