Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms