Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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FOXQ1Q9C009 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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