Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DNAH10-201ENST00000409039 14473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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