Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CNGB1Q14028 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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