Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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