Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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