Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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