Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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LINC00587B1AMM8 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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LINC00587B1AMM8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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LINC00587B1AMM8 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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LINC00587B1AMM8 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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LINC00587B1AMM8 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
LINC00587B1AMM8 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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