Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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