Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ERCC8-201ENST00000265038 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SRSF10-206ENST00000374453 866 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CBWD5-205ENST00000377395 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SNORA7.3-201ENST00000384186 139 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TMEM199-202ENST00000395404 971 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DMKN-205ENST00000414866 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZFY-AS1-201ENST00000417305 500 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01865-201ENST00000430529 845 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR2AI1P-201ENST00000448534 932 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ASS1P12-201ENST00000452496 1227 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TAF8-205ENST00000465926 1222 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL122013.1-201ENST00000473054 801 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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ANKRD39Q53RE8 RPL12P6-201ENST00000495231 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC02548-201ENST00000531749 484 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SMAD3-203ENST00000537194 1147 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P4-201ENST00000550578 1213 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC020779.2-201ENST00000568984 393 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC005580.1-202ENST00000587140 562 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MXRA7-205ENST00000588114 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNHIT3-204ENST00000617429 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR8078-201ENST00000619811 84 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL359834.1-201ENST00000635660 638 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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