Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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ECM1Q16610 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ECM1Q16610 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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