Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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