Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RYR3Q15413 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KIAA0930-202ENST00000336156 8119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RYR3Q15413 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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