Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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RAB39AQ14964 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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