Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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COL4A6Q14031 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL4A6Q14031 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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