Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL512504.2-201ENST00000445455 1909 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PSG8-203ENST00000404209 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SEMA3C-203ENST00000419255 2415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC125421.2-201ENST00000580370 583 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC093768.1-201ENST00000505987 2173 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LINC02102-201ENST00000503989 3364 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TP63-204ENST00000392460 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC087501.5-201ENST00000607496 2374 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 OR7A17-201ENST00000327462 1127 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SNORD3J-201ENST00000408473 190 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC012506.4-202ENST00000430051 572 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
MKRN4PQ13434 RPL3P10-201ENST00000476002 1164 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms