Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHRNEQ04844 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms