Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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LMOD1P29536 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
LMOD1P29536 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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