Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRMP28827 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRMP28827 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRMP28827 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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PTPRMP28827 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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