Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP452-201ENST00000363004 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 GSTA5-202ENST00000370989 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL353705.3-201ENST00000418694 1250 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC116050.1-206ENST00000423774 213 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL157395.1-201ENST00000427630 438 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP001630.1-201ENST00000428410 437 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC073873.1-201ENST00000433950 276 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1G1P3-201ENST00000442568 280 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL391825.1-202ENST00000458136 741 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC004917.1-202ENST00000475791 760 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC084398.1-201ENST00000494902 459 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AP002469.1-201ENST00000526011 1043 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL132712.1-201ENST00000555967 582 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RNF219-AS1-213ENST00000607860 577 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC027139.2-201ENST00000615639 448 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC239585.2-201ENST00000624269 557 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P3-201ENST00000417549 1385 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms