Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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HERC1Q15751 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HERC1Q15751 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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