Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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