Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CLN3Q13286 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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