Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECHS1P30084 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms